3ª e 4ª viagem:

Já na terceira parte Na ilha Flutuante de Laputa, Swift criticou a Royal Society, a administração inglesa na Irlanda e a imortalidade, através da descrição dos habitantes dos países por onde Gulliver passou, com alienados cientistas, é uma feroz crítica ao pensamento cientifico que não traz benefícios para a humanidade.

Na última viagem Gulliver encontrou os Houyhnhm, uma raça de cavalos que possuía muita inteligência, que representavam os ideais iluministas da verdade e da razão. Os Houyhnhm temiam que alguém dos Yahoo (uma raça imperfeita de um tipo de "humanos") movidas por instintos primitivos, se tornasse culto, satirizando a raça humana. Gulliver vê a humanidade como yahoos e toma nojo do ser humano.
Por fim Gulliver regressou a Inglaterra para ensinar aos outros as virtudes que aprendera com os Houyhnhm.

Durante este período, ao mesmo tempo em que explicava para o "amo" Houyhnhnm sobre a capacidade humana de conviver, conhecer, transformar conhecimento em ciência e usá-la em prol do avanço e da conquista, me dei conta da pequenez, da crueldade, da frieza e do quanto o ser humano é capaz de machucar e de desprezar e trair em favor da ganância e da avareza.